第6集：迷惑之森，与真真司的再度相遇国语配音
第4集：波加曼对战含羞苞小光的初ม次战斗！国语配音
1999年路基亚的爆诞
小智、小霞、小健及皮卡丘一行人来到了橘子群岛，在路途上遇到了暴风雨把他们吹到了亚西亚岛上，来到这里刚好村民在举行祭典，在祭典上小智从芙萝拉的口中听到一个古老的传说，“火之ใ神、雷之神、冰之ใ神不可以擅自触及，否则天地的愤怒将令世界ศ走向灭亡”。这时坏人为ฦ了达到自己้的目标抓洛奇亚，不惜破坏这个古老的传说，在祭典上芙萝拉要小智成为拯救世界ศ的人，但必须得到三样宝物，这三样宝物分别在火之岛、雷之岛、冰之岛。小智去火之岛的路途中却遇到暴风雨，这时候，芙萝拉认为是她让小智走向危险的地方，所以芙萝拉、小霞、小健就决定去找小智．这时在火之ใ岛的小智与皮卡丘要离开时遇到火箭队，而就在火箭队要强夺皮卡丘时，芙萝拉一行人刚好来到。芙萝拉与小智说话的同时，闪电鸟出现在火之岛，就在皮卡丘用它的电击与闪电鸟说话时，坏人出现了，它把闪电鸟的能ม源吸收后就抓了闪电å鸟，连同小智一行人也被抓了。到เ底小智等人会如何呢？
2000年结晶塔的帝王
小智的口袋妖怪与炎帝展开了激烈的战斗，但终究是不禁k，幸亏此时为了帮助小智的喷火龙及时赶到，利ำ用强大的火焰攻击与飞行能ม力不断攻击，但最终炎帝还是凭借着未知图腾神奇的力量打败了喷火龙，就在要解决喷火龙的一瞬，小莉终于醒悟阻止了炎帝ຓ，正在这一切向大结局发展的时候，未知图腾却因失去了小莉的意识而暴走了！炎帝帮助小莉与小智他们一路脱逃，来到เ了未知图腾的所在地，但所有的攻击在未知图腾群的精神力量下全都无效。最后，炎帝舍身攻击，在小莉信赖的意识下终于打乱了未知图腾的活动。结晶城恢复了原样，小莉的爸爸妈妈也回来了，只是那ว存在又消失了的炎帝，到เ底是真身还是一个ฐ瞬间的幻影呢？我们不得而知……
2001้年雪拉比穿越时空的遭遇
在电影开始开篇，场景被设置在40年前的一片大森林中。一个叫小羽的男孩想进去那ว个森林去画画,在森林内,ไ小羽遇到เ了被神奇宝贝猎人追捕并受重伤的雪拉比,当他们被神奇宝贝猎人追的走投无路的时候,雪拉比带着小羽到了40年后也就是现代,ไ正好小智他们在这森林里,ไ他们救了小羽,小羽告诉了小智他们关于雪拉比的事,小智他们救了雪拉比,ไ并和他成为了好朋友
与此同时，火箭队的三干部之ใ一比夏斯ั也在寻找着并打算捕猎雪比拉。他
比夏斯拥有能将一切神奇宝贝变得凶恶的黑暗球，将雪拉比自小智他们的身边夺走。为了拯救被比夏斯捕捉的雪拉比，小智与小羽拼命奋战。可是，温柔的雪拉比已经发生了很大的变化……
激烈的对战中ณ，传说中的神奇宝贝水君出现了！小智他们能ม否拯救雪拉比和森林呢！？
2002年水都的守护神
传说，从图书馆的小偷开始……
水都，小精灵水上冲浪比赛，拉提亚斯1想帮小智，结果小锯鳄却走错方向。小霞以微弱差距获得冠军。
亚军载小智等人游览水都，并讲述这个ฐ城市的美丽传说。
发现桑兰与莉奥的火箭队，决定先她们一步，成为ฦ新的小偷no1。
桑兰与莉奥追捕变成人形卡侬的拉提亚斯ั，小智英雄救美，拉提亚斯ั跑得无影无踪。
小智等人参观博物馆，看到真正卡侬，小智上前搭话，被骂。小智一路追赶卡侬，又遇到เ了变成人形卡侬的拉提亚斯，被带入神秘花园。
小智与卡侬和博物馆的爷爷化解误会，了解心灵水珠的美丽传说，回去与小霞、小刚ธ汇合。
桑兰与莉奥行动开始！拉提奥斯为了救拉提亚斯被抓住，心灵水珠也被抢走。拉提亚斯变成人形跑去找小智求援，在小霞、小刚ธ面前
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现出真实面目。
武藏小次郎依然肩负起跑龙套的重任……
莉奥利用拉提奥斯与心灵水珠的力量开始发飙。
小霞、小刚被突然出现的铁栅栏困住，小智与拉提亚斯ั勇往直前，摆脱复活的化石神奇宝贝的追杀，终于救出拉迪奥斯，但此时心灵水珠借由古代机器发动的巨เ大潮水即将摧毁城市……
已是奄奄一息的拉提奥斯ั为了保护水都和妹妹而牺牲。
小智等人将心灵水珠放回原位。
最后，码头边，卡侬送给小智一幅画，并与小智一吻告别ี……
当然还有，桑兰与莉奥在牢中继续研究着她们未来的小偷事业，武藏小次郎则继续着他们未来的跑龙套事业……
2003年七夜的许愿星
千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现……
立志成为出色的神奇宝贝训练师的小智、小遥和小胜，带着皮卡丘展开了新的旅๓程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到恩斯ั游乐场，并认识魔术师巴特勒与戴安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声…
那ว是在〝沉眠之茧〞中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝——基拉祈。在千年彗星出现的夜晚，如果遇到เ拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来，巴特勒请小胜当基拉祈的伙伴，果然，基拉祈从万花镜般的光芒中苏醒过来。
虽然基拉祈只能ม停留短暂的七日就会再消失，但是头一次拥有属于自己้的神奇宝贝的小胜，对基拉祈却非常宠爱。充满野心的魔术师巴特勒，因为知道基拉祈具有神奇的力量，便把基拉祈给抢走，并且想利用他来完成愿望。
不怀好意的巴特勒，他的愿望是什么呢？小智与小胜要如何克服困难，成功救出同伴呢？小胜与基拉祈又会面临怎样的生离死别呢？
200่4年裂空的访问者代欧奇希斯ั
裂空的访问者代欧奇希斯
destinydeoxys
台湾电视上映日：20่06年4月15日
日本上映日：200่4年7月17日
美国发片日：2๐005年2月15日
片长1时39分
四年前被烈空坐消灭的迪欧西斯，四年之后来到科技发达的拉罗斯市，而小智皮卡丘等人也来到这里，在那里，他们遇到了少年托伊，托伊因为四年前的事情留下阴影而不敢与宠物小精灵接触迪欧西斯的宇宙落下导致小精灵们的逃跑吓怕了托伊来到拉罗斯市的迪欧西斯是什么？托伊的心结能否解除？
正当他们努力想让托伊克服恐惧时，忽然，消失四年的迪欧西斯又再度出现！小智一行人和托伊也再次体会到迥然不同的惊异体验和惊心动魄的冒险。在这极光般的舞台中，烈空坐和迪欧西斯再度卯足全劲地互相激战，可说是魄力百分百！究竟烈空坐和迪欧西斯的战斗ç会如何？而迪欧西斯这次回来究竟要的是什么？最后又会发生什么令人意想不到的意外危机呢？
200่5๓年梦幻和波导的勇者
持续旅行的小智皮卡丘一行，访问了流传着波导传说的城镇。在城市的中心奥兰多城，举ะ行着数百年前使用了世界创始之ใ树的力量中止纷争的“波导之勇者——亚伦”的祭典。小智与皮卡丘决定参加今年勇者对战。激烈的战斗之后，获得了冠军的小智当选为“波导之勇者”。城中举办了庆祝优胜者的盛大宴会。突然幻之宠物小精灵“梦幻”出现。然而梦幻却带着皮卡丘消失了身影。与此同时，“迷之宠物小精灵”鲁卡利欧数百年前的封印被解开，在小智面前显现了身影的！皮卡丘在哪？梦幻的目的是什么？还有，隐藏在鲁卡利ำ欧身上的过去和波导传说的秘密是什么？带者所有谜团，小智与鲁卡利ำ欧一起向着世界创始之树开始了冒险。
2๐006年沧海的王子
在这世界上海洋某处，即将诞生一只谁都不知道的传说神奇宝贝。以广大的海洋为舞台，神奇宝贝史上最大的任务即将开始！在荒地迷路的小智一行人遇到了一位女性“广美”，以水中神奇宝贝表演而出名的码头巡回团明星。
广美是水之民的后裔，可以体会水系神奇宝贝的内心。小智等人便听广美诉说着水之民流传已久的传说。原来在海洋某处，水之民一族建造了“海ร之神殿－亚库夏”，里面供奉隐藏着珍宝“海ร之王冠”。
但目前据说谁也没看过这顶王冠的实体模样。这时，追寻着传说之ใ谜的神奇宝贝援助员“杰克·渥克”昵称杰奇出现了。原来杰奇正执行一项机密任务，那就是要把苍海的王子──玛纳霏的蛋给安然送进神殿里。于是广美和小智等人也协助这项任务。忽然这时！出现了有“魅影”之称的海ร盗船长开来的大型潜水舰。原来魅影想要夺取王冠，借住王冠的神力来策划征服世界。但是要解开王冠隐藏的谜团，似乎还需要靠玛纳霏的蛋。这时连火箭队都想过来分一杯羹，造成了大混乱！
为了抵制魅影的阴谋，杰奇开始用捕获器借住许多神奇宝贝的力量，小智他们也拿出自己的神奇宝贝准备应战。但毕竟对方的高科技潜水舰威力太强，顿ู时陷入危机！神秘的蛋此时发出灿烂的光芒，玛纳霏终于诞生了！隐藏于王冠珍宝里的秘密是？而玛纳霏的神秘力量又是？最后杰奇和小智等人的任务究竟能不能圆满成功呢？！现在，准备朝向海之神殿－亚库夏，目睹这精采的冒险吧！